Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 OR4K14-202ENST00000641793 1245 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC092119.2-201ENST00000616774 1491 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC100803.1-201ENST00000501440 1380 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC023050.4-201ENST00000538830 1380 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 SAA3P-202ENST00000534768 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 CNIH1-207ENST00000557690 838 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC022400.7-201ENST00000625041 1236 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 RSRC1-202ENST00000312179 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 CFDP1-201ENST00000283882 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 RLN2-201ENST00000381627 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC025171.2-201ENST00000451894 1218 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNB1Q02641 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms