Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM3AP98173 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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