Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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EFNB1P98172 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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EFNB1P98172 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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EFNB1P98172 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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EFNB1P98172 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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EFNB1P98172 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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EFNB1P98172 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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EFNB1P98172 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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EFNB1P98172 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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EFNB1P98172 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EFNB1P98172 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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