Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CRB1P82279 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRB1P82279 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CRB1P82279 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CRB1P82279 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CRB1P82279 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRB1P82279 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRB1P82279 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CRB1P82279 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CRB1P82279 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CRB1P82279 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CRB1P82279 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRB1P82279 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRB1P82279 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRB1P82279 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CRB1P82279 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRB1P82279 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRB1P82279 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRB1P82279 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRB1P82279 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRB1P82279 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CRB1P82279 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRB1P82279 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRB1P82279 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CRB1P82279 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRB1P82279 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CRB1P82279 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CRB1P82279 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CRB1P82279 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CRB1P82279 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CRB1P82279 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CRB1P82279 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CRB1P82279 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CRB1P82279 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CRB1P82279 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CRB1P82279 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CRB1P82279 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CRB1P82279 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CRB1P82279 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CRB1P82279 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CRB1P82279 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRB1P82279 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB1P82279 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB1P82279 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB1P82279 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB1P82279 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB1P82279 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB1P82279 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB1P82279 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB1P82279 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB1P82279 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB1P82279 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB1P82279 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB1P82279 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB1P82279 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB1P82279 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB1P82279 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB1P82279 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB1P82279 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB1P82279 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB1P82279 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB1P82279 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB1P82279 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB1P82279 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB1P82279 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB1P82279 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB1P82279 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRB1P82279 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms