Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMF1P82094 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMF1P82094 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMF1P82094 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms