Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VBP1P61758 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VBP1P61758 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VBP1P61758 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VBP1P61758 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VBP1P61758 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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VBP1P61758 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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VBP1P61758 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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VBP1P61758 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VBP1P61758 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VBP1P61758 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VBP1P61758 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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