Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
LINC01547P58512 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms