Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM3BP58499 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms