Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RAD23AP54725 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms