Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TTPAP49638 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TTPAP49638 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TTPAP49638 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTPAP49638 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTPAP49638 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTPAP49638 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTPAP49638 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTPAP49638 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTPAP49638 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTPAP49638 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTPAP49638 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTPAP49638 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTPAP49638 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTPAP49638 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTPAP49638 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTPAP49638 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TTPAP49638 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTPAP49638 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTPAP49638 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTPAP49638 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
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