Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP2P42575 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP2P42575 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CASP2P42575 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP2P42575 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP2P42575 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP2P42575 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP2P42575 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP2P42575 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP2P42575 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP2P42575 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP2P42575 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP2P42575 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CASP2P42575 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP2P42575 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP2P42575 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP2P42575 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP2P42575 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP2P42575 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP2P42575 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP2P42575 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP2P42575 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP2P42575 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP2P42575 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP2P42575 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP2P42575 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP2P42575 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP2P42575 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP2P42575 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP2P42575 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP2P42575 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP2P42575 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP2P42575 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP2P42575 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP2P42575 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP2P42575 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP2P42575 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP2P42575 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP2P42575 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP2P42575 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP2P42575 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP2P42575 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP2P42575 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP2P42575 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CASP2P42575 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CASP2P42575 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP2P42575 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP2P42575 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP2P42575 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP2P42575 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP2P42575 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP2P42575 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP2P42575 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP2P42575 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CASP2P42575 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms