Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MMP12P39900 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MMP12P39900 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MMP12P39900 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MMP12P39900 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MMP12P39900 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
MMP12P39900 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MMP12P39900 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MMP12P39900 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MMP12P39900 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MMP12P39900 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MMP12P39900 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MMP12P39900 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MMP12P39900 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP12P39900 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP12P39900 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP12P39900 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP12P39900 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP12P39900 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP12P39900 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP12P39900 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP12P39900 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP12P39900 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP12P39900 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP12P39900 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP12P39900 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP12P39900 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP12P39900 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP12P39900 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP12P39900 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP12P39900 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP12P39900 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP12P39900 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP12P39900 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP12P39900 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP12P39900 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP12P39900 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP12P39900 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP12P39900 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP12P39900 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MMP12P39900 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP12P39900 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP12P39900 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP12P39900 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP12P39900 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP12P39900 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP12P39900 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP12P39900 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP12P39900 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP12P39900 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP12P39900 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP12P39900 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP12P39900 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP12P39900 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP12P39900 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP12P39900 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP12P39900 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP12P39900 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP12P39900 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP12P39900 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP12P39900 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP12P39900 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP12P39900 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP12P39900 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MMP12P39900 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms