Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FDFT1P37268 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FDFT1P37268 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms