Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTN2P35609 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms