Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RORAP35398 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RORAP35398 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RORAP35398 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RORAP35398 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RORAP35398 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RORAP35398 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms