Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHRNA3P32297 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms