Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLIP1P30622 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLIP1P30622 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms