Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRMP28827 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRMP28827 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
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