Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBL1P28749 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBL1P28749 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RBL1P28749 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBL1P28749 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RBL1P28749 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RBL1P28749 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RBL1P28749 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBL1P28749 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBL1P28749 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBL1P28749 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBL1P28749 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBL1P28749 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBL1P28749 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBL1P28749 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBL1P28749 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBL1P28749 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBL1P28749 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBL1P28749 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBL1P28749 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBL1P28749 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBL1P28749 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBL1P28749 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RBL1P28749 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms