Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX2P28328 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PEX2P28328 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PEX2P28328 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PEX2P28328 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PEX2P28328 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PEX2P28328 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PEX2P28328 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PEX2P28328 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PEX2P28328 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PEX2P28328 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX2P28328 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms