Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSFA2P28290 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms