Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB4P28070 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms