Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PTPRBP23467 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms