Protein–RNA interactions for Protein: P15328

FOLR1, Folate receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR1P15328 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FOLR1P15328 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms