Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFTRP13569 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFTRP13569 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFTRP13569 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFTRP13569 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFTRP13569 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFTRP13569 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFTRP13569 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFTRP13569 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFTRP13569 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFTRP13569 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CFTRP13569 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFTRP13569 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CFTRP13569 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFTRP13569 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFTRP13569 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFTRP13569 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFTRP13569 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFTRP13569 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFTRP13569 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFTRP13569 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFTRP13569 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFTRP13569 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFTRP13569 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFTRP13569 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFTRP13569 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFTRP13569 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFTRP13569 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFTRP13569 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFTRP13569 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFTRP13569 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFTRP13569 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFTRP13569 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFTRP13569 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFTRP13569 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFTRP13569 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFTRP13569 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFTRP13569 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFTRP13569 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFTRP13569 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CFTRP13569 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFTRP13569 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFTRP13569 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CFTRP13569 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CFTRP13569 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CFTRP13569 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFTRP13569 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFTRP13569 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFTRP13569 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CFTRP13569 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFTRP13569 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFTRP13569 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFTRP13569 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFTRP13569 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFTRP13569 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFTRP13569 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFTRP13569 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFTRP13569 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFTRP13569 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFTRP13569 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFTRP13569 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFTRP13569 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFTRP13569 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFTRP13569 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFTRP13569 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFTRP13569 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFTRP13569 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFTRP13569 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CFTRP13569 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFTRP13569 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFTRP13569 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFTRP13569 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFTRP13569 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CFTRP13569 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFTRP13569 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFTRP13569 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFTRP13569 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CFTRP13569 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFTRP13569 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFTRP13569 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFTRP13569 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFTRP13569 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFTRP13569 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFTRP13569 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFTRP13569 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFTRP13569 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFTRP13569 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFTRP13569 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFTRP13569 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFTRP13569 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFTRP13569 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFTRP13569 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFTRP13569 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFTRP13569 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFTRP13569 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFTRP13569 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFTRP13569 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFTRP13569 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFTRP13569 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFTRP13569 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms