Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACTN1P12814 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACTN1P12814 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms