Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFTPCP11686 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms