Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CHRNB1P11230 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms