Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGAMP11215 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms