Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC175P0C221 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms