Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GJB1P08034 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms