Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CENPBP07199 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CENPBP07199 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPBP07199 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPBP07199 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPBP07199 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPBP07199 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPBP07199 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPBP07199 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPBP07199 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPBP07199 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPBP07199 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPBP07199 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPBP07199 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPBP07199 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPBP07199 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPBP07199 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPBP07199 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CENPBP07199 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CENPBP07199 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CENPBP07199 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms