Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEFLP07196 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFLP07196 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFLP07196 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFLP07196 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFLP07196 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFLP07196 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFLP07196 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFLP07196 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFLP07196 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFLP07196 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFLP07196 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFLP07196 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFLP07196 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFLP07196 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFLP07196 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFLP07196 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFLP07196 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFLP07196 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFLP07196 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFLP07196 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFLP07196 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFLP07196 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFLP07196 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFLP07196 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFLP07196 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFLP07196 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFLP07196 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFLP07196 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEFLP07196 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEFLP07196 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEFLP07196 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEFLP07196 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEFLP07196 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEFLP07196 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEFLP07196 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEFLP07196 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEFLP07196 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEFLP07196 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEFLP07196 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEFLP07196 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEFLP07196 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms