Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBX7O95931 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBX7O95931 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX7O95931 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms