Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLDN9O95484 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms