Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TLX3O43711 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TLX3O43711 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TLX3O43711 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLX3O43711 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLX3O43711 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLX3O43711 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLX3O43711 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TLX3O43711 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms