Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DENRO43583 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DENRO43583 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DENRO43583 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DENRO43583 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DENRO43583 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DENRO43583 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DENRO43583 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DENRO43583 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DENRO43583 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DENRO43583 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
DENRO43583 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DENRO43583 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DENRO43583 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DENRO43583 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DENRO43583 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DENRO43583 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DENRO43583 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DENRO43583 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DENRO43583 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DENRO43583 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.04■□□□□ -0
DENRO43583 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DENRO43583 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms