Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BHLHE40O14503 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BHLHE40O14503 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms