Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms