Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVV-1B6SEH8 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms