Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
B4DGG1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
B4DGG1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DGG1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DGG1 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DGG1 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DGG1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DGG1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DGG1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DGG1 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DGG1 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DGG1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DGG1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DGG1 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DGG1 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DGG1 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DGG1 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
B4DGG1 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms