Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC144AA2RUR9 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC144AA2RUR9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms