Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
E2F8A0AVK6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms