Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SH3BP1Q9Y3L3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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