Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS3Q9UNS2 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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