Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CTNNA3Q9UI47 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms