Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIPSNAP3AQ9UFN0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 357.5 ms