Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RRBP1Q9P2E9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RRBP1Q9P2E9 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms