Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC180Q9P1Z9 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC180Q9P1Z9 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms