Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

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Length 4,599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LRP1BQ9NZR2 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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